A tudomány és az ipar együttműködésének eredményeként egy innovatív módszer született a növénybetegségek leküzdésére a natív jótékony talajbaktériumokkal.
A John Innes Center (Egyesült Királyság) tudósaiból álló csoport Pseudomonas baktériumok százait izolálta és tesztelte a mezőgazdasági vállalkozásokból származó talajból, majd 69 genomját szekvenálták.
A kórokozók aktivitását elnyomó törzsek genomjának összehasonlításával a csapatnak sikerült azonosítania a burgonyatermés káros baktériumokkal szembeni védelmének kulcsfontosságú mechanizmusát.
Ezután a kémia és a genetika kombinációjával, valamint egy sor kísérlettel a tudósok kimutatták, hogy a ciklikus lipopeptideknek nevezett kis molekulák termelése fontos a burgonya varasodás (egy bakteriális betegség, amely jelentős károkat okoz a burgonyatermésben) leküzdésében. Ezek a kis molekulák antibakteriális hatást fejtenek ki a patogén baktériumokra, amelyek varasodást okoznak, és segítik a hasznos Pseudomonas baktériumok mozgását és megtelepedését a növény gyökereiben.
A kísérletek azt is kimutatták, hogy az öntözés jelentős változásokat okoz a talajban található Pseudomonas genetikailag változatos populációjában.
Az eLife-ben megjelent tanulmány egy olyan módszert javasol, amellyel a tudósok a terület gyakorlatilag bármely területén tanulmányozhatják a mikrobiomát, és figyelembe vehetik a különböző talaj-, agrokémiai és környezeti viszonyokat.
A nagy sebességű genetikai szekvenálás fejlődésének felhasználásával a szakértők tesztelhetik a talaj mikrobiómát a hasznos baktériumok számára, és meghatározhatják, hogy mely molekulák termelődnek a kórokozók elnyomására. A következő lépés a hasznos mikroorganizmusok szaporítása és visszajuttatása ugyanabba a mezőbe.
A mikrobiomfokozók lehetséges felhasználási területei közé tartozik a bakteriális koktélok felvitele a gumók felületére permetezésként vagy közvetlenül a talajba csepegtető öntözéssel.